Blood Sugar Sex Magik и первый уход Фрушанте (1990—1992)
В 1990 после успеха Mother’s Milk группа решила, что нужно прекратить сотрудничество с EMI и вступила в большую войну лейблов. В конечном итоге был подписан контракт с Warner Bros. Records и был нанят Рик Рубин в качестве продюсера их тогда ещё не названного пятого альбома. Рубин, который впоследствии спродюсирует все последующие альбомы группы, сначала отказался, ссылаясь на наркотическую зависимость Хиллела и Энтони. Во второй же раз он чувствовал, что группа в лучшем состоянии и настроена на работу. Написание самого альбома было более продуктивным, чем это было с Mother’s Milk. Как сказал Кидис: «Каждый день была новая музыка, чтобы я написал для неё слова». Группа провела шесть месяцев, записывая альбом. Однако Рубин был недоволен обычной звукозаписывающей студией, думая, что группа будет работать лучше без православной настройки и что это повысит их творческую продуктивность. Рубин предложил особняк, в котором когда-то жил волшебник Гарри Гудини, и все согласились. Музыканты решили, что останутся в особняке на все время работы над альбомом, однако Смит, убежденный, что в доме были приведения, отказался остаться. Но он приезжал туда каждый день на мотоцикле. Фрушанте согласился со Смитом и сказал, что «в замке действительно есть приведения», но в отличие от Смита, он думал, что они были «очень дружелюбными. Мы [группа] могли чувствовать только теплые вибрации и счастье повсюду в этом доме». Рубин сейчас является владельцем звукозаписывающей студии, известной как «Особняк». Во время записи, музыканты согласились дать разрешение брату Фли на съемку. Когда запись альбома была завершена, Chili Peppers выпустили видео под названием Funky Monks. Группа не могла решить, каким должно быть название альбома, но Рубин обожал одну из песен, которая называлась «Blood Sugar Sex Magik». Хотя она и не была одной из обработанных песен, Рубин считал, что это будет «честно говоря самое лучшее название». Blood Sugar Sex Magik был выпущен в сентябре 1991 года. «Give It Away» была первым синглом, которая стала в конце концов самой популярной и узнаваемой песней группы. В 1992 году музыканты получили за неё Грэмми за «лучшее хард-рок выступление с вокалом» и она стала первой песней, которая попала в Modern Rock чарт. Баллада «Under the Bridge» была вторым синглом и достигла второго места в Billboard Hot 100 chart, выше группа забиралась только в 2011 году, и стала одной из самых узнаваемых песен группы. Другие синглы, такие как «Breaking the Girl» и «Suck My Kiss» также хорошо поднялись в чартах. Сам альбом стал мировой сенсацией и был продан тиражом в 15 миллионов копий, расширил круг фанатов группы и стал иконой. Blood Sugar Sex Magik занимает 310 место в списке «500 величайших альбомов» по версии журнала Rolling Stone и в 1992 он занял 3 место в чарте U.S, спустя почти год с выхода самого альбома. Неожиданный успех мгновенно превратил Red Hot Chili Peppers в звезд рока. Фрушанте был ошеломлен неожиданной славой и изо всех сил старался справиться с этим. Сразу же после выхода альбома в нём начало расти недовольство в популярности группы и начал нарастать конфликт между ним и Кидисом. Кидис вспоминает, что они с Фрушанте привыкли вступать в горячие споры после концертов: «Джон постоянно говорил, что мы слишком популярны. Я не хочу быть на этом уровне успеха. Мы должны гордиться тем, что мы играем музыку в клубах, как вы, ребята, делали это два года назад». Последние выступления с Фрушанте были хаосом. Он не был связан с группой и часто играл не те партии, что западало глубоко под кожу Кидису. В тайне от остальных, Фрушанте снова пристрастился к наркотикам, а также перестал общаться со всеми, кроме своей девушки. Он резко покинул группу за пару часов до выступления во время тура Blood Sugar Japanese в 1992 году. Музыканты протянули руку Дейву Наварро, который только что ушёл из Jane’s Addiction, однако он был слишком увлечен своими битвами с наркотиками. Группа репетировала с Зандером Шлоссом, однако спустя какое-то время, они поняли, что он не в лучшей форме. Гитарист Арик Маршалл заменил Фрушанте и группа возглавила фестиваль Lollapalooza в 1992 году[. Маршалл также появится в видео «Breaking the Girl», «If You Have to Ask» и в конце 4 сезона Симпсонов, «Krusty Gets Kancelled». В сентябре 1992 года, Peppers сыграли «Give It Away» на MTV Video Music Awards. Группа была номинирована семь раз, включая «Видео года» (которое они проиграли). Однако они взяли три номинации, включая «Выбор зрителей». 24 февраля 1993 года, группа вместе с Джорджем Клинтоном и P.Funk All-Stars и Weapon of Choice исполнили «Give It Away» на церемонии вручения премии Грэмми, песню, которая выиграла первую статуэтку Грэмми в истории группы. Это выступление означало окончание Blood Sugar Sex Magik тура и было последним выступлением Маршалла с группой. Музыканты планировали продолжать играть в том же составе с Маршаллом. Однако все быстро меняется, и он уже не вписывался в их будущие планы. На его место был нанят Джесси Тобиас, основатель группы Mother Tongue. Однако его пребывание в группе не продлились долго. Группа решила провести открытые прослушивания, которые стали огромным беспорядком. Фли предложил вернуть Дейва Наварро и в этот раз он согласился и снова был готов играть.